Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms