Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04213 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04213 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04213 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04213 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04213 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms