Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01852 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01852 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01852 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01852 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01852 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01852 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01852 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01852 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01852 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms