Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01788 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01788 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01788 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01788 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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