Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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