Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp2O88623 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms