Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms