Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms