Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms