Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col5a1O88207 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col5a1O88207 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Col5a1O88207 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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