Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms