Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms