Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms