Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole2O54956 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms