Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CrxO54751 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CrxO54751 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CrxO54751 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CrxO54751 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms