Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc4O35988 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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