Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm2O35900 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms