Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms