Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Klf9O35739 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf9O35739 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms