Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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