Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms