Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn9O35239 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms