Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms