Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc23O35125 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms