Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps1O08983 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms