Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r80L7N1Z3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms