Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms