Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms