Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm19965J3QNY8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm19965J3QNY8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm19965J3QNY8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm19965J3QNY8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm19965J3QNY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm19965J3QNY8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm19965J3QNY8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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