Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc180J3QNE4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms