Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Zfp616J3QN14 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Zfp616J3QN14 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp616J3QN14 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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