Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms