Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms