Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms