Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms