Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm28048F7BCN0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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