Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms