Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms