Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms