Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf165E9QAU8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms