Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms