Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms