Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc146E9Q9F7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc146E9Q9F7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms