Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
6030445D17RikE9Q8F9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms