Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp31E9Q6Y8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
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Usp31E9Q6Y8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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