Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms