Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Susd1E9Q3H4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Susd1E9Q3H4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Susd1E9Q3H4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Susd1E9Q3H4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Susd1E9Q3H4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Susd1E9Q3H4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Susd1E9Q3H4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Susd1E9Q3H4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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