Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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