Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms