Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms